Link to NCBI Front Page Taxonomy Logo
Entrez PubMed Nucleotide Protein Genome Structure PMC Taxonomy BioCollections
   
Taxonomy browser (Merkel cell polyomavirus)

Merkel cell polyomavirus

Taxonomy ID: 493803 (for references in articles please use NCBI:txid493803)
current name
Merkel cell polyomavirus
equivalent:
MCPyV isolate R17b
NCBI BLAST name: viruses
Rank: no rank
Genetic code: Translation table 1 (Standard)
Host: human
Lineage( full )
Viruses; Monodnaviria; Shotokuvirae; Cossaviricota; Papovaviricetes; Sepolyvirales; Polyomaviridae; Alphapolyomavirus; Alphapolyomavirus quintihominis
   Entrez records   
Database name Direct links
Nucleotide 574
Protein 975
Structure 10
Genome 1
Popset 24
GEO Datasets 166
PubMed Central 2,020
Gene 6
SRA Experiments 80
Protein Clusters 3
Identical Protein Groups 350
BioProject 9
BioSample 77
Assembly 1
Taxonomy 1

View and Analyze sequences in NCBI Virus
ICTV homepage

External Information Resources (NCBI LinkOut)

LinkOut Subject LinkOut Provider
GOLD: Go0084411 organism-specific Genomes On Line Database
Show Biotic Interactions taxonomy/phylogenetic Global Biotic Interactions
Related Immune Epitope Information gene/protein/disease-specific Immune Epitope Database and Analysis Resource
642483464: Merkel cell polyomavirus organism-specific Integrated Microbial Genomes
Wikipedia taxonomy/phylogenetic iPhylo
Notes:
Groups interested in participating in the LinkOut program should visit the LinkOut home page.
A list of our current non-bibliographic LinkOut providers can be found here.

Information from sequence entries

Organism modifiers

To hide organism modifiers click here
strain
1314' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1] 542' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1] 557' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1] 563' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1]
568' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1] 592' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1] 593' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1] 599' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1]
615' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1] 619' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1] 627' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1] 638' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1]
659' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1] 695' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1] 708' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1] 7673/2011/HUN [1 5]
910' /Country='Cote d'Ivoire:NearbyTai National Park [1 1] AP/BR [2 4] AmePI [1 1 4] EurCauC1 [1 1 4]
J-SCC [2 2] JPN-SK-MCC1 [1 3] JPN-SK-MCC2 [1 3] JPN-SK-MCC3 [1 3]
JPN-SK-MCC4 [1 3] JPN-SK-MCC5 [1 3] JPN-SK-MCC6 [1 3] JPN-SK103 [2 3]
JPN-SK134 [2 3] JPN-SK140 [2 3] JPN-SK15 [2 3] JPN-SK163 [2 3]
JPN-SK17 [2 3] JPN-SK170 [2 3] JPN-SK173 [2 3] JPN-SK174 [2 3]
JPN-SK187 [2 3] JPN-SK198 [2 3] JPN-SK211 [2 3] JPN-SK224 [2 3]
JPN-SK227 [2 3] JPN-SK26 [2 3] JPN-SK27 [2 3] JPN-SK29 [2 3]
JPN-SK31 [2 3] JPN-SK65 [2 3] JPN-SK71 [2 3] JPN-SK82 [2 3]
JPN-SK98 [2 3] JPN-TM-MCC1 [1 3] JPN-TM-MCC2 [1 3] JPN-TM-MCC3 [1 3]
JPN-TM-MCC4 [1 3] JPN-TM-MCC5 [1 3] MCPyV1 [1 1 1] MCPyV2 [1 1 1]
MCPyV3 [1 1 1] MCPyV4 [1 1 1] MCPyV5 [1 1 1] MCPyV6 [1 1 1]
MCPyV7 [1 1 1] MCPyV8 [1 1 1] MCV ITA 61 [1 1] MCV ITA 71 [1 1]
MCV-B1 [2 2] MCV-B2 [2 2] MCV-B3 [2 2] MPPP125 [1 1]
MPS65 [1 1] Merkel/S50-SI/CO/2018 [1 1 1] OcepolW1 [1 1 4] SK1068 [1]
SK1090 [1] SK1134 [1] SK1138 [1] SK198 [1]
TKS [1 4]
isolate
06b [1 1 4] 09b [1 1 4] 10b [1 1 4] 12a [1 1 4]
12b [1 1 4] 1314/Cote d'Ivoire [1 1] 13a [1 1 4] 14a [1 1 4]
14b [1 1 4] 15a [1 1 4] 15b [1 1 4] 16b [1 1 4]
17b [1 1 4] 18b [1 1 4] 206 [1 1 2] 20b [1 1 4]
25b [1 1 4] 26b [1 1 4] 30b [1 1 4] 322 [1 1 2]
339 [1 1 2] 344 [2 1 6] 345 [1 1 2] 347 [1 1 2]
348 [1 1 2] 349 [2 1 6] 350 [1 1 2] 352 [2 1 6]
366 [1 1 2] 412/Congo [1 1] 418/Congo [1 1] 434/Congo [1 1]
454/Congo [1 1] 459/Congo [1 1] 463/Congo [1 1] 467/Congo [1 1]
470/Congo [1 1] 477/Congo [1 1] 491/Congo [1 1] 500/Congo [1 1]
509/Congo [1 1] 513/Congo [1 1] 516/Congo [1 1] 542/Cote d'Ivoire [1 1]
557/Cote d'Ivoire [1 1] 563/Cote d'Ivoire [1 1] 568/Cote d'Ivoire [1 1] 592/Cote d'Ivoire [1 1]
593/Cote d'Ivoire [1 1] 599/Cote d'Ivoire [1 1] 615/Cote d'Ivoire [1 1] 619/Cote d'Ivoire [1 1]
627/Cote d'Ivoire [1 1] 638/Cote d'Ivoire [1 1] 659/Cote d'Ivoire [1 1] 695/Cote d'Ivoire [1 1]
708/Cote d'Ivoire [1 1] 85 [2 1 5] 910/Cote d'Ivoire [1 1] 915 F 06 001 PJ2 [1 1 5]
915F 06 002 KN4 [1 1 5] 915F 06 004 BG1 [1 1 5] 915F 06 005 FS2 [1 1 5] 915F 06 007 FD3 [1 1 5]
915F 06 008 CG4 [1 1 5] AA-10 [1 1] AG-1 [1 1] AfrBad468 [3 3 3]
AfrBad541 [3 3 3] AfrBak74 [1 1 1] AfrNm020 [3 3 3] AfrNm023 [1 1 1]
AfrNm026 [1 1 1] AfrNm45 [3 3 3] AfrNm51 [3 3 3] AfrNm70 [3 3 3]
AlDo [1 4] AmeJH [3 3 3] AmeKK [3 3 3] AmeKR [3 3 3]
AmeKS [3 3 3] AmePA [3 3 3] AmePI [3 3 3] Appendix206 [3 5]
Asi-Hm130 [1 1 1] Asi-Hm225 [1 1 1] Asi-HmLT [1 1 1] Asi-HmYY [1 1 1]
BCN [1 1] BCN8 [2 1 2] BR_MCV_10S [1 1 1] BR_MCV_13S [1 1]
BR_MCV_19S [1 1 1] BR_MCV_22S [1 1 1] BR_MCV_BCC3 [1 1 1] BR_MCV_BCC4 [1 1 1]
BR_MCV_BCC51 [1 1 1] BR_MCV_BCC72 [1 1 1] BR_MCV_BCC9 [1 1 1] BroLi [1 3]
CH10PBMC [1 1 1] CH1MCC [1 1 1] CH1PBMC [1 1 1] CH1US [1 1 1]
CH20MCC [1 1 1] CH20NS [1 1 1] CH20US [1 1 1] CH28MCC [1 1 1]
CH28NS [1 1 1] CH29MCC [1 1 1] CH2MCC [1 1 1] CH2NS [1 1 1]
CH31PBMC [1 1 1] CH32MCC [1 1 1] CH32PBMC [1 1 1] CH33MCC [1 1 1]
CH33NS [1 1 1] CH3MCC [1 1 1] CH3US [1 1 1] CH4MCC [1 1 1]
CH4US [1 1 1] CH7MCC [1 1 1] CVG-1 [1 2] DyskA [1 5]
EurCauC1 [3 3 3] EurCauC2 [3 3 3] FraMerk1 [1 1 2] FraMerk11 [1 1 2]
FraMerk2 [1 1 5] FraMerk20 [1 1 5] FraMerk22 [1 1 5] FraMerk23 [1 1 2]
FraMerk24 [1 1 5] FraMerk26 [1 1 2] FraMerk29 [1 1 2] FraMerk3 [1 1 2]
FraMerk30 [1 1 2] FraMerk31 [1 1 2] FraMerk32 [1 1 2] FraMerk33 [1 1 2]
FraMerk34 [1 1 2] FraMerk36 [1 1 2] FraMerk40 [1 1 2] FraMerk8 [1 1 2]
FraMerk9 [1 1 2] HB039C [1 5] HF [1 4] J1 [1 1 1]
J11 [1 1 1] J2 [1 1 1] J3 [1 1 1] J5 [1 1 1]
J6 [1 1 1] J7 [1 1 1] J8 [1 1 1] J9 [1 1 1]
JKS2 [1 1 1] JPN MCC33 [2 2] JPN MCC34 [1 2] JPN MCC35 [1 2]
JPN MCC36 [1 2] JPN MCC37 [1 2] JPN MCC38 [1 2] JPN MCC42 [1 2]
JPN MCC43 [1 2] JPN MCC45 [5 3] JPN MCC46 [1 2] JPN MCC47 [1 2]
JPN MCC48 [1 2] JPN MCC49 [1 2] JPN MCC52 [1 1] JPN MCC53 [1 2]
JPN MCC54 [1 2] JPN MCC55 [1 2] JPN MCC56 [3 1] JPN MCC60 [1 2]
JPN MCC61 [3 4] JPN MCC62 [1 2] JPN MCC65 [3 4] JPN MCC66 [4 2]
JPN MCC67 [1 2] JPN MCC68 [4 2] JPN MCC70 [4 3] JPN MCC73 [2 3]
JPN MCC74 [1 2] KIB [1 4] KIP1 [1 5] KLC [1 4]
LC-JK1 [2 3] LC-JK17 [1 2] LC-JK29 [2 3] LC-JK35 [2 3]
LoKe [1 4] M-10 [1 1 1] M-28_8 [1 1 1] M-9-11.1 [1 1 1]
M-9-11.10 [1 1 1] M-9-11.11 [1 1 1] M-9-11.13 [1 1 1] M-9-11.14 [1 1 1]
M-9-11.3 [1 1] M-9-11.4 [1 1 1] M-9-11.5 [1 1] M-9-11.6 [1 1 1]
M-9-11.7 [1 1] M-9.11 [1 1 1] M-905 [1 1 1] M-B149.1 [1 1 1]
M-B149.10 [1 1] M-B149.11 [1 1] M-B149.14 [1 1 1] M-B149.16 [1 1]
M-B149.18 [1 1] M-B149.2 [1 1 1] M-B149.3 [1 1] M-B149.4 [1 1 1]
M-B149.6 [1 1] M-BCN12 [1 1 1] M-BCN149 [1 1 1] M-BCN159 [1 1 1]
M-BCN160 [1 1 1] M-BCN4 [1 1 1] M-BCN76 [1 1 1] M-U10 [1 1 1]
M-U10.1 [1 1 1] M-U10.12 [1 1 1] M-U10.14 [1 1 1] M-U10.15 [1 1 1]
M-U10.17 [1 1 1] M-U10.18 [1 1 1] M-U10.2 [1 1 1] M-U10.20 [1 1 1]
M-U10.22 [1 1] M-U10.23 [1 1] M-U10.24 [1 1 1] M-U10.3 [1 1]
M-U10.4 [1 1 1] M-U10.6 [1 1 1] M-U10.8 [1 1 1] M-U10.9 [1 1 1]
M-U11 [1 1 1] M-U17 [1 1 1] M-U18 [1 1 1] M-U20 [1 1 1]
M-U21 [1 1 1] M-U25 [1 1 1] M-U26 [1 1 1] M-U28 [1 1 1]
M-U29 [1 1 1] M-U35 [1 1 1] M-U37 [1 1 1] M-U38 [1 1]
M-U42 [1 1 1] M-U45 [1 1 1] M-U46 [1 1 1] M-U5 [1 1 1]
M-U6 [1 1 1] M-U7 [1 1 1] M-U8 [1 1 1] M-cg-28-8.1 [1 1 3]
M-cg-28-8.10 [1 1 1] M-cg-28-8.12 [2 2 2] M-cg-28-8.13 [2 2 2] M-cg-28-8.14 [2 2 2]
M-cg-28-8.16 [1 1 3] M-cg-28-8.2 [1 1 1] M-cg-28-8.3 [2 2 2] M-cg-28-8.4 [2 2 2]
M-cg-28-8.5 [2 2 2] M-cg-28-8.6 [2 2 2] M-cg-28-8.8 [2 2 2] M-cg-9-11.1 [1 1 5]
M-cg-9-11.2 [2 2 2] M-cg-9-11.3 [1 1 4] MCC-JK16 [2 3] MCC-JK19 [2 3]
MCC-JK24 [2 3] MCC-JK8 [2 3] MCC-JR3 [2 3] MCC-JT17 [2 3]
MCC-JT7 [2 3] MCC-Mpt-LS1 [1 2] MCC-Mpt-LS2 [1 2] MCC-Mpt-NLS1 [1 2]
MCC-Mpt-NLS3 [1 2] MCC-Mpt-NLS4 [1 2] MCC339 [4 9] MCC350 [5 11]
MCC611-8-175 [1 1] MCC79_BCC [1] MCC79_MCC [1] MCCL21 [1 1 2]
MCCw162 [1 1 2] MCCw168 [1 1 2] MCCw197 [1 1 1] MCCw205 [1 1 1]
MCCw214 [1 1 1] MCCw219 [1 1 1] MCPyV-Kurdi [1 1] MCPyV_124/Sweden [1 2]
MCV-37 [1 1] MCV-38 [1 1] MCV-IT1 [1 2] MCV-IT2 [1 2]
MCV-IT3 [1 2] MCV-IT4 [1 2] MCV-IT5 [1 2] MCV-IT6 [1 2]
MCVw156 [1 6] MCVw160 [1 1] MCVw179 [1 1] MCVw205 [1 1]
MCVw234 [1 1] MCVw235 [1 1] MCVw244 [1 1] MCVw250 [1 1]
MCVw347 [1 1] MCVw447 [1 1] MKL-1 [1 1 4] MKL-2 [1 1 2]
MKT-21 [2 3] MKT-22 [1 2] MKT-23 [2 3] MKT-26 [2 3]
MKT-31 [2 3] MKT-32 [1 1] MKT-33 [2 3] MS-1 [1 1 2]
NFE [1 2] NPA105 [1 1] NPA271 [1 1] NPA367 [1 1]
NPA370 [3 3] NPA397 [1 1] NPA447 [1 1] NPA527 [1 1]
NPA532 [1 1] NPA68 [1 1] NPA83 [1 1] OceMelNC1 [3 3 3]
OceMelNC2 [3 3 3] OceMelNC3 [1 1 1] OcepolW1 [3 3 3] PeTa [1 3]
R17a [1 1 4] R17b [2 1 8] R30a [1 1 4] SCC-JK [1 2]
SCC-JK5 [2 3] W162 [1 1] WaGa [1 4] WoWe [1 4]
non-MCC-Mpt-1 [1 2] non-MCC-Mpt-2 [1 2] non-MCC-Mpt-3 [1 2]
nat-host
Homo sapiens [58]

Disclaimer: The NCBI taxonomy database is not an authoritative source for nomenclature or classification - please consult the relevant scientific literature for the most reliable information.

Reference: How to cite this resource - Schoch CL, et al. NCBI Taxonomy: a comprehensive update on curation, resources and tools. Database (Oxford). 2020: baaa062. PubMed: 32761142 PMC: PMC7408187.


Comments and questions to info@ncbi.nlm.nih.gov

[Help] [Search] [NLM NIH] [Disclaimer]